SMA Nabil Husein Samarinda menyiapkan ruang belajar/kelas khusus bagi siswa putra dan puti. Jadi kami memisah antara ruang belajar siswa putra dantri tidak di dalam satu kelas yang sama dan berada di kawasan yang berbeda juga. Hal ini untuk menjaga aktifitas siswa putra dan putri tidak bercampur dan menghindarkan siswa siswi kami terhindar dari hal-hal yang tidak kami inginkan.
